Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRDP23468 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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