Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CXCL2P19875 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL2P19875 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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