Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ODC1P11926 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODC1P11926 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODC1P11926 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ODC1P11926 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ODC1P11926 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ODC1P11926 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms