Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYP2C9P11712 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CYP2C9P11712 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CYP2C9P11712 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CYP2C9P11712 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP2C9P11712 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP2C9P11712 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP2C9P11712 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP2C9P11712 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP2C9P11712 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP2C9P11712 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP2C9P11712 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP2C9P11712 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYP2C9P11712 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms