Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf89P0DMQ9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms