Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPBP07199 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPBP07199 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPBP07199 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPBP07199 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CENPBP07199 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPBP07199 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms