Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATE1O95260 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATE1O95260 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATE1O95260 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATE1O95260 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATE1O95260 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATE1O95260 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATE1O95260 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATE1O95260 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATE1O95260 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATE1O95260 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATE1O95260 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATE1O95260 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATE1O95260 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATE1O95260 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATE1O95260 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms