Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms