Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKAP2O75563 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms