Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PPFIA4O75335 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PPFIA4O75335 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms