Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CYTIPO60759 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms