Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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HOXA3O43365 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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HOXA3O43365 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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HOXA3O43365 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXA3O43365 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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