Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NBASA2RRP1 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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