Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
KLF12Q9Y4X4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms