Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9Y3F1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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