Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM2AQ9Y2K7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM2AQ9Y2K7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM2AQ9Y2K7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM2AQ9Y2K7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM2AQ9Y2K7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM2AQ9Y2K7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM2AQ9Y2K7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM2AQ9Y2K7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms