Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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COPS3Q9UNS2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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COPS3Q9UNS2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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COPS3Q9UNS2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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COPS3Q9UNS2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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COPS3Q9UNS2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS3Q9UNS2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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