Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLEC4AQ9UMR7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms