Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFMBT1Q9UHJ3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms