Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHPF2Q9P2E5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms