Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIS18AQ9NYP9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms