Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TBCCD1Q9NVR7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TBCCD1Q9NVR7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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