Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FZD3Q9NPG1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms