Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ELL3Q9HB65 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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