Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4CQ9C0C4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms