Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC2Q9C0B9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms