Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CARD11Q9BXL7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms