Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RIOK2Q9BVS4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms