Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP58Q9BVL2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP58Q9BVL2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms