Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD2Q9BSE4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms