Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms