Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MYCBPQ99417 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MYCBPQ99417 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms