Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC38A2Q96QD8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC38A2Q96QD8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms