Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C2orf48Q96LS8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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