Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BICD1Q96G01 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BICD1Q96G01 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms