Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT1Q96EB6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT1Q96EB6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms