Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DPF3Q92784 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms