Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDI1Q8WTU0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms