Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIPC3Q8TF64 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIPC3Q8TF64 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms