Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HJURPQ8NCD3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms