Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF148Q8N7C7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms