Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC71Q8IV32 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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