Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF550Q7Z398 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms