Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM46CQ5VWP2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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