Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPANXN3Q5MJ09 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms