Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms