Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHKAPQ2M3C7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHKAPQ2M3C7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
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