Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ATP6V1FQ16864 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ATP6V1FQ16864 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms