Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B3Q16720 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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