Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FSCN1Q16658 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms